上海交通大学医学院附属第九人民医院中医科成立于1956年，至今已60余年。历届科主任卢其成、胡国庆、戚清权、周阿高、游捷。2016年9月南北两院融合后，中医科现有医护人员28人，其中主任医师4人，副主任医师9人，博士学位9人，硕士学位8人。全国老中医药专家继承人3人，博士生导师1人，硕士生导师1人。

近十余年，主持和参加国家科技攻关计划、国家十五科技攻关计划、国家重大新药平台创新计划、国家自然基金面上项目、上海市科委、上海市卫生局、上海市教委及院级基金课题三十余项，发表SCI及国家级核心期刊论文80余篇，主编著作2部。多人次在国内和上海市口腔、肿瘤、外科等专业委员会担任主任委员、副专业委员、常务委员、委员、秘书等职务。

中医科设有四个临床分科包括中医内科、中医伤外科、针灸科和长皮膏科。设有四个专病专科，包括中医肿瘤科，中医妇科，中医皮肤科，中医乳腺病科。

在临床工作中，科室始终坚持发展中医特色，针药结合，并重视中西医疗法并用等原则，力求采用综合治疗方式为患者提供最优质的医疗服务。

科室成员长年参与和承担上海交通大学医学院口腔医学院和九院临床医学院研究生和本科生的中医理论教学任务，以及蚌埠医学院本科中医基础理论的教学任务。主编教材2部；其中《中医口腔科学》获得上海交通大学医学院（原上海第二医科大学）教材建设二等奖，《中医学》获得上海交大医学院优秀教材二等奖、上海市教委颁发的优秀教材奖。