神经外科是医院重点建设学科，南方科技大学硕士学位授权点，集临床、教学、科研为一体的综合专业学科。
神经外科开放床位55张，其中神经重症监护室(NICU)8张。拥有专科一体化数字手术室，配置最新一代DiscoveryIGS7OR系统DSA、术中B超、术中电生理监测仪、高端3D荧光显微镜、超高清神经和脊柱内镜及配套系统、美敦力手术动力系统、美国Mayfield二代头架和德国DORO可透射线头架、立体定向仪、蛇牌手术器械等先进手术设备。科室拥有中央心电监护系统、进口多功能呼吸机、Codman和SOPHYSA颅内压监护仪、冰毯机、肢体气压治疗仪等专科仪器设备。能满足神经外科各类手术需求。
神经外科共有医护人员22名，其中神经外科专科医师10人：主任医师3人，主治医师4人，住院医师3人，均拥有博硕士研究生学历。
神经外科技术力量雄厚，诊疗经验丰富。联合神经内科成立神经医学中心，推动多学科协作，建成卒中中心一体化治疗流程。科室以神经脊柱脊髓、脑血管病介入（缺血和出血）、中枢感染性疾病为特色，设有神经脊柱脊髓（疼痛治疗）、脑血管病、神经肿瘤、神经创伤、功能神经外科、中枢感染（HIV、结核、隐脑）等6个亚专科。
