深圳第三人民医院内科是医院重点发展科室，主要从事消化系统疾病（肝、胆、脾、胰和胃肠病）的医疗、教学和研究工作，设有消化内科实验室、胃肠动力检测室、消化内窥镜室，拥有数条胃镜、结肠镜、十二指肠镜、超声内镜等，开展胃镜、结肠镜检查，内镜治疗（食道狭窄扩张术及支架放置术、食管及胃底静脉曲张内镜治疗、急诊内镜止血、内镜下消化道息肉电凝或微波治疗术、内镜下消化道早期癌肿电凝或微波治疗术、内镜下乳头肌切开取石、内镜下逆行胰胆管造影术等），胃肠动力检测，消化道激素检测，超声或CT引导下胰腺穿刺术，经皮经肝胆道造影，肝血管造影，一秒钟肝活检，B超引导下肝穿刺线纯酒精或药物注射治疗肝癌、肝囊肿、肝脓肿，B超引导下脾穿刺注射治疗脾功能亢进等。