心胸外科是宝安人民医院外科重点科室。在深圳市该领域处于领先水平。 胸科方面曹庆东主任医师在开展常规食道，肺，纵隔手术治疗之外还在胸腔镜胸部疾病外科手术治疗等方面进行了富有成效的探索，并且取得了业界公认的成果。 心脏外科面由心脏外科首席专家计乐群主任领导。主要开展婴儿（1-12月龄）及各年龄阶段先天性心脏病，心脏瓣膜病，冠心病，大动脉疾病等的外科手术治疗。