肿瘤中心1998年成立，床位66张，住院人数达到1523人次，是深圳市西部规模最大、设备齐全、技术力量雄厚的肿瘤专科。肿瘤中心分为肿瘤内科、肿瘤外科、肿瘤放疗科、肿瘤介入科。拥有博士导师2名，博士6名，高级及副高级职称医生12名。成立伊始就严格按照指南对每个病种进行规范诊断及治疗。开展常见的乳腺癌、肺癌、结直肠癌内科治疗的临床路径探索，至今已完成数千例患者的临床路径诊治，获得国家级殊荣——全国仅有的19家的“2011年中华人民共和国卫生部全国市、县级医院常见肿瘤规范化诊疗试点医院”的科室。肿瘤外科引进学科带头人庞作良博士生导师，开展手术包括甲状腺癌、乳腺癌、肺癌、食管癌、胃结直肠癌、肝癌等根治术。放疗科拥有直线加速器等放疗设备，可开展三维适形调强等先进技术的放疗。介入科拥有2台DSA等多种介入消融设备，可对各种恶性肿瘤的精准介入治疗。肿瘤科未来的目标是把肿瘤中心发展为深圳地区甚至广东地区比较有影响力的科室，把病床增加到300张，放疗直线加速器增加到5台，增加无痛病房及临终关怀病房等亚专业。