临床医学研究中心是深圳市人民医院医学研究和研究生培养的基地，首先承担着培养博士、硕士研究生，以及为临床医务人员科研工作提供技术服务的任务；其次利用科室人才优势和设备优势，承担各类大型科研课题，担起培育和扶持重点学科发展，创造我院的“名牌”效应任务。另外在充分利用已有的大型设备的条件下，为临床提供一些相关的检验项目，提高医院的医疗水平和服务于患者。
医院先后投入经费1000万元，购置了国际上最先进的大型医疗设备如流式细胞仪、基因芯片扫描仪、DNA测序仪、遗传工作站、原子吸收仪、胰岛分离机、荧光倒置显微镜等各类科研设备，具有1000多平米的实验室和420平方米的动物实验室，并引进国外知名学者和医学博士4名，在深圳地区成为最具影响力的医学研究机构。中心按研究方向下设干细胞与细胞移植实验室、产前诊断实验室、医用纳米技术实验室和动物实验室。
近三年来中心承担国家863项目一项，国家973计划前期专项一项，广东省自然科学基金（重点）项目5项，以及其它省市级科研项目15项，获各类资助350万元。申请国家发明专利4项，发表在SCI和国内权威期刊论文30余篇，获广东省和深圳市科学技术进步奖5项。
各实验室研究方向：开放实验室（公共技术平台）●利用中心的人才优势、技术优势、设备优势建设成为深圳市卫生系统和深圳市生物技术领域的公共技术平台(开放实验室)，为深圳市医疗卫生系统科学研究，以及深圳市生物医药领域工程技术研究和产品开发提供技术保障。
干细胞与细胞移植实验室（深圳市人民医院器官移植中心器官移植实验室）研究方向：
●人类同种异体胰岛移植治疗I型糖尿病。●各类干细胞转分化为胰岛内分泌细胞及糖尿病实验治疗。
●干细胞在治疗糖尿病足、心肌梗塞、脊髓横断性损伤等疾病实验研究。
●器官移植的组织配型、免疫监测、药物监测。医用纳米技术实验室研究方向●纳米靶向药物研究。●应用纳米技术，对现有诊断试剂进行技术升级，开发具有知识产权的诊断试剂。
●应用纳米技术解决生物医学领域的各种技术问题。产前诊断实验室（深圳市人民医院产前诊断中心产前诊断实验室）研究方向：
●应用近代医学遗传学的方法直接或间接了解胎儿在子宫内的健康状况。
●通过脐血、羊水、绒毛进行染色体核型分析。●通过直接基因诊断技术和通过连锁分析完成遗传病诊断，即可诊断现症患者，又可诊断症状前患者。
动物实验室：●SPF级小型动物实验室，提供各类小型动物饲养、动物实验条件。
●清洁级大型动物实验室，提供兔、猫、狗、猪等动物饲养、动物实验条件。
