康复医学科成立于1998年9月，当时是在骨科的基础上发展起来的。并相继派出3名医师、1名技师、7名护士前往香港威尔斯亲王医院接受康复培训。率先在省内开展了术前、术后运动训练；康复护理干预训练，简单的支具制作，为康复医学科的规范奠定了良好的基础。

2009年3月在院领导关怀和大力支持下，重新对康复医学科进行整合，从骨科脱离出来，将针灸科、理疗科、按摩科共同组建成综合的康复医学科，单独设立病区，开设康复运动疗法。何晓宏担任第一任科室主任。康复医学科设立病床30张，全科共有医师12名，其中高级职称5名，康复治疗师7名，推拿技师1名，康复护士8名。同时购置了全自动牵引床、减重跑步机、偏瘫治疗仪等大型治疗设备，建立康复运动治疗室。创建了特色科室，弘扬中西医结合现代康复理念，引进现代康复技术，形成了以中医基础理论与现代康复理念相结合，针灸治疗为主，辅以康复体疗的一整套行之有效的有中国特色的康复模式。在针灸治疗的同时积极引进现代康复运动治疗、作业治疗、言语治疗等手段，开展了脑卒中康复、脑外伤康复、骨伤康复、周围神经康复、骨关节炎的康复、周围性面瘫康复等系列治疗。并对患者进行科学的康复评定，提高了中风等病症的治疗质量，极大提高了临床疗效，受到广大患者的一致好评，在社会上产生了较好的影响，努力为患者打造了最佳的康复环境；成为青海省首家建制较为完整的康复医学科。

在2010年的抗震救灾的康复工作中，医院康复医学科表现突出，第一时间内成立抗震救灾治疗组，针对灾区患者在全院范围内实施康复训练计划，承担了地震伤员及省外部分伤员的集中收治康复工作，使伤员获得最大限度的康复，减低了致残率，得到了患者以及卫生部专家的高度好评，并且协助卫生部康复治疗专家组，两次在全省范围内举办地震伤员康复培训。同时积极与国际助残组织接洽，接受了28万元的设备捐赠，对全省康复医学的发展起到了较大的促进作用。

针灸专业方面，人员业务结构合理，其中主任医师一名，副主任医师两名，具有较高的专业水平，业务拓展广泛，滲透于临床各个科室。积极实现业务创新，开展新技术，新疗法。首先自1998年至今连续10余年开展了“冬病夏治”穴位敷贴在治疗慢性支气管炎，效果显著，得到了广大患者的好评，取得了良好的社会及经济效益。其次，近年来针灸门诊发挥中西医结合治疗的优势，开展了床旁针灸与穴位注射等治疗方法，方便患者的治疗，得到了临床各科广泛的认可。针灸门诊具有教学经验丰富的师资队伍，长期承担青海大学医学院针灸等专业的理论教授及实习带教工作。先后派出4名医师赴布隆迪援外医疗，出色的完成了卫生部交给的援外医疗任务，在国际上取得了较高的声誉。推拿按摩门诊专业力量较强，副主任医师一名，在颈椎病、腰椎病及小儿内科等疾病治疗方面积累了丰富的临床经验。

理疗科成立于1959年，至1990年一直隶属于门诊管理，由吕海珍同志任理疗门诊主任。自2009年并入康复医学科成为理疗门诊。根据科室发展需要，理疗门诊引进了具有省内外较为先进的治疗设备，在青海省处于领先地位。自合并入医学科后，在现代康复医学模式及国际康复理念的指导下，理疗门诊先后派出2名技师学习先进康复治疗技术，夯实理疗理论及实践知识，发挥物理治疗在康复治疗中的优势，扩宽了治疗范围，为物理治疗的发展前景提供了更大的空间。

基于医院属全省最大的临床教学基地，长期承担青海大学附属医院的康复学、针灸学、康复护理学的教学工作，为青海省的康复医学的发展奠定了坚实的基础。全科共开展科研4项；三新技术项目20余项；发表论文近百篇；并著《青海地区康复医学培训手册》一部。成为集科研、教学、临床为一体的综合学科。

近年来医院康复医学科与香港复康会等康复专业组织积极合作，从2009年至今共派出7名医师、7名技师、5名护士前往深圳及香港参加香港复康会举办的康复再教育课程，以提高科室业务水平。康复医学科在不断发展提高的同时也为全省康复医学的发展做出自身应有的贡献，并于2012年与香港复康会联合举办了青海地区首届康复医学继续教育项目暨运动治疗理论与实践培训班。并不断为省内各州县的基层康复工作者进行培训工作，积极在全省范围内推广康复理念。

由于医院康复医学科自成立以来积极投身于康复事业的发展，并以规范的康复治疗体系，良好的康复治疗效果，在青海省康复医学发展中处于示范地位，因此青海省卫生厅批准由医院于2012年组织成立了青海省康复医学会，并挂靠医院开展相关工作。2013年医院康复医学科继续加快发展脚步，与香港复康会继续合作签订了为期1年的医院能力建设项目，以完善科室各项管理及治疗规范，形成更加系统及规范的医疗及治疗体系。同时在青海省卫生厅的指派下完成卫生部为期70天的青海省首届康复治疗人员培训班，并成为青海省康复治疗师培训基地，为青海省康复人才的培养做出了杰出贡献。