心血管外科是本院重点科室之一。成立以来，在院领导的大力扶植下，全科人员团结一致、艰苦拼搏，紧随学科发展步伐。在自主创新的同时加强与上级医院的交流学习，北京安贞医院时国际知名的心血管外科专科医院，经过严格考察将我院定位内蒙古自治区一家对口协作医院，同时我科还与沈阳陆军总院心脏外科、北京中日友好医院心脏血管外科、北京人民医院血管外科、北京西苑医院血管外科等全国知名专业科室保持密切友好的联系，在以上友好科室的帮扶下，在全体心血管外科人员的共同努力下我科专业水平达到我市甚至自治区一流；

心脏外科的发展始于2001年，在院领导的大力支持下，科室得到了飞速发展。2005年达到连续100例心脏外科手术无死亡的骄人成绩；2010年7月，基于我科室在心脏外科领域的高超水平，我院被自治区卫生厅指定为先天性心脏病儿童免费治疗内蒙古东部区一家定点医院。这是自治区卫生厅对科室在心脏外科工作成绩的认可，值得我们骄傲。同时医院也是红十字会先心病救助项目定点单位；目前我科常规开展先天性心脏病矫治、风湿性心脏病瓣膜置换及冠心病冠状动脉搭桥手术，达到本市领先水平；

血管外科于2003年开展，基于心脏外科的坚实基础，血管外科一开始就在重症及大血管疾病患者的治疗上具有其他医院不可比拟的优势，同年即完成3例颈动脉瘤切除自体血管原位移植术，填补我市空白。2005年科室引进自治区第一台大隐静脉激光治疗仪，2007年自主创新的改良激光技术治疗大隐静脉曲张在自治区属领先技术，并在自治区血管外科年会上作交流发言。同时我科在大动脉夹层动脉瘤的治疗方面达到自治区领先水平，目前能完成主动脉夹层覆膜支架腔内隔绝术的医疗单位；糖尿病足及下肢动脉硬化性疾病的治疗方面，我科与北京西苑医院结成友好科室，在他们的大力协助下，我科在此领域跻身国内水平，并成功开展多例疑难重症患者，最高龄93岁。静脉血栓的治疗上，我科在自治区内率先应用临时及可回收滤器，积累了大量经验，给患者更为合理有效的治疗。