通辽市医院为适应社会的发展及医疗卫生事业的进步，根据通辽市肛肠疾病诊断设备简陋、技术滞后的现实，面对通辽地区310万人民的需求及综合性医院专科化发展的趋势，于2004年8月成立了通辽地区最大影响力最强的肛肠病治疗中心，从而使我市对肛肠疾病的诊疗，达到了系统化、规模化、专业化的高度，结束了我市无规模性专门诊疗肛肠病的历史。近期成为自治区重点学科。
通辽市医院肛肠科启用了我市肛肠病专家、北京中医药大学毕业的肛肠科硕士研究生徐建华主任医师等一批肛肠病临床骨干，并投入150万元人民币，引进肛肠科科研及临床诊疗设备。其中有结肠水疗机；电子痔疮治疗仪；肛管直肠压力测定仪；肛肠机电图等。中心的医疗技术、设备及发展方向无疑达到了肛肠专科化治疗的国内领先水平。
通辽市医院肛肠科设有床位20张；医生5人，其中主任医师1人，副主任医师2人，主治医师1人，住院医师1人；护士8人，其中副主任护师1人，主管护师6人，护师1人。
通辽市医院肛肠科率先开展的我市肛肠科空白诊疗项目有：
1．治疗痔疮的世界顶尖技术-PPH技术（采用美国强生公司生产的的一次性、无痛性痔上粘膜环切吻合器治疗痔疮。）
2．结肠水疗技术（利用结肠水疗仪清洗大肠中的粪便及毒素恢复肠壁神经丛的功能。适用于便秘、肠炎、痢疾、寄生虫、肠梗阻等疾病）。
3．便秘的手术治疗技术（适用于出口梗阻型便秘即直肠前突、尺骨直肠肌综合症、盆底松弛等）。
主治：内痔、外痔、混合痔、肛瘘、肛裂、脱肛、肛乳头肥大、肛周脓肿，直肠粘膜内脱垂，便秘，尖锐湿疣、结肠黑病变，结肠、直肠炎，结肠、直肠息肉，结肠、直肠癌等疾病。
通辽市医院肛肠科与北京中医药大学附属医院肛肠科，中国中医研究院附属医院肛肠科，北京市二龙路肛肠医院建立了协作关系，指导全市基层医疗单位开展肛肠病的诊疗工作，接受市内外肛肠病医生前来进修。
