内蒙古医科大学附属医院妇产科科室专业齐全，特色突出，分为产科、普通妇科、妇科恶性肿瘤、妇科腔镜、计划生育、生殖医学中心六个亚专科，并设有遗传实验室，阴道细胞学实验室，细胞培养实验室，基因诊断实验室，是自治区在遗传、优生、不孕、计划生育、生殖内分泌、妇科疾病、妇科肿瘤、腔镜及高危孕产妇诊治等方面最具有显著特色和优势的科室，科室于1997--2009年连续三次被评为内蒙古自治区领先学科、重点学科。获得国家级“爱婴医院”的称号，2006年获国家卫生部“十年百项宫颈病变的筛查--PCC”内蒙古地区分中心的称号。科室人员总数212名。医疗人员53名，分别为教授（主任医师）18名，副教授（副主任医师）11名，主治医师14名，其中具有博士学位4名，硕士学位37名。护理人员143名；其中副主任护师以上13名。病区目前设有床位207张；共设5个护理单元，完成年均门诊、急诊量13万5千余人次，年均住院病人9270人次，年均手术近5000余台。妇科从2012年开始聘请北京人民医院王建六教授为特聘教授，开展腹腔镜下子宫内膜癌根治术、宫颈癌根治术、卵巢癌手术及盆底重建术等高精尖四级手术。

妇产科近年来开展了瘢痕妊娠阴式切除术、阻抗下子宫内膜去除术；腹腔镜下子全切术、子宫肌瘤挖除术、卵巢囊肿剥除术及各种输卵管病变的诊治；宫腔镜下子宫畸形的诊治、宫腔粘连分解术、子宫内膜电切术、黏膜下子宫肌瘤切除术；女性生殖整复：女性私密整形美容、激光技术与女性生殖道整形；子宫脱垂合并子宫肌瘤经腹子宫切除阴道骶骨固定术；坐骨棘前筋膜悬吊治疗盆器脱垂；改良式老年妇女盆器脱垂阴道封闭术；盆底重建手术、张力性尿失禁手术；阴道成形术；尿瘘修补术；阴式子宫切除术；盆底脱垂非手术治疗：上子宫托、产后及盆底脱垂患者盆底康复训练；在全区率先开展并规范了宫颈癌前病变及妇科恶性肿瘤（卵巢癌、宫颈癌、内膜癌、外阴癌、滋养细胞肿瘤）的治疗；开展了宫颈癌新辅助化疗、恶性肿瘤腹主动脉旁淋巴结清除术、改良外阴癌根治术等。