内蒙古医学院附属医院血液内科是我区最早创建的血液病专科，设有独立的实验室和干细胞移植中心。率先在我区开展了多项新技术新业务，并与全国多家血液中心协作，对白血病，再生障碍性贫血及出血性疾病进行了深入的研究，达到了国内先进水平、现在正成为我区血液学疾病研治核心。本科室是内蒙古自治区重点学科；国家药理临床试验基地，也是在我国西部地区唯一的药品临床试验基地专业。多年来承担多项新药的临床试验。

层流病房2间，独立的血液病实验室，拥有骨髓细胞检查图文报告系统及染色体检查图文报告系统，奥林帕斯显微镜4台，超净台、细胞孵育箱各一台等。

内蒙古医学院附属医院血液内科主要开展各种原因贫血、出血的诊断治疗；急、慢性再生障碍性贫血、骨髓异常增生综合征的诊断及综合治疗；难治性血小板减少性紫癜及自身免疫性溶血性贫血的综合治疗；恶性血液病及实体肿瘤的生物治疗，白血病及淋巴瘤大剂量化疗，骨髓移植等服务项目。近年来新开展了血液肿瘤的染色体检查、耐药基因检查，细胞表面抗原的检测等先进的诊疗技术，为更准确的诊断、合理有效的治疗提供了科学的保证。