中日友好医院病理科承担全院临床病理、细胞学检查及病理科研教学及病理会诊工作，年外检工作量约3万例，术中快速冰冻切片诊断年工作量约2500例;组织化学及免疫组织化学染色5万张;开展体表肿块穿刺细胞学检查、脱落细胞学检查年工作量1万多例;年接收其他地区疑难病例切片会诊约1000例。
科室长期以来注重新技术的引进与新业务的开发，强调科研与临床工作相结合。现已开展组织化学染色、免疫组化、免疫荧光、实时荧光定量PCR等病理学先进技术。
积极参与协和医科大学及北京大学医学部等医学院校的教学工作，2011年被批准为北京市住院医师培训基地，接收轮转、实习、进修医师，为医学后备人才培养做出相应的贡献。
科室同时承担多项国家级、省部级、院级科研项目，其中包括国家863重大课题(肺癌是分子分型与诊治)分题，人体干细胞治疗重大疾病的研究与应用等。每年举办“全国胸部肿瘤病理诊断”学习班。
科室重视人才培养与梯队建设。现有医技人员35人，其中主任医师3人，副主任医师2人，博士10人，硕士8人，主管技师4人，技师/技士11人。
病理科将秉承“自强不息，止于至善”之宗旨，发扬“团结敬业，求实创新”的精神，以“博爱至仁之德，精益求精之术”服务于广大患者。
科室主要服务项目：承担普通病理、快速病理、免疫病理及分子病理、超微病理诊断，以及细胞学病理诊断。
普通病理检查：常规石蜡切片的组织病理学诊断。快速病理检查：将手术中切除的组织在冰冻状态下快速制片，经染色后供病理医师
进行快速诊断，确定病变性质并将结果发给手术医生。细胞学病理诊断：对脱落细胞(痰、胸水、腹水等)、穿刺细胞学(甲状腺穿刺、淋巴结穿刺、气管镜)进行病理诊断。
免疫病理：应用免疫学及组织化学原理，对标本中的某些化学成分进行定性、定位及定量分析的技术。主要应用于以下方面：
恶性肿瘤的诊断与鉴别诊断确定转移瘤的原发部位对某类肿瘤进行进一步的病理分型软组织肿瘤的组织学分类发现微小转移灶为临床提供治疗方案的选择病原微生物检测分子病理：应用分子生物学方法检测患者体内遗传物质的结构或表达水平的变化而做出诊断的技术;分子诊断的材料包括DNA、RNA和蛋白质;主要技术有核酸分子杂交(如FISH)，聚合酶链反应(如PCR)等;是病理诊断先进的辅助手段。
提高病理诊断的准确性(淋巴瘤基因重排、甲状腺癌BRAF基因突变检测等)
指导肿瘤的治疗(EGFR、KRAS、BRAF等基因突变检测)
病原微生物检测(如结核杆菌、幽门螺旋杆菌、人乳头状瘤病毒等病原检测)
疑难病例会诊：接受全国各地区病人的病理会诊。仪器设备：病理科目前拥有罗氏全自动多功能组织病理检测系统、DAKO自动免疫组化染色仪、全封闭快速组织脱水机、组织包埋机、樱花及LEICA石蜡切片机、冷冻切片机、樱花全自动染色盖玻片封片工作站、全自动染色机、封片机、直线型自动染色机、美国CYTYCCORP全自动细胞制备仪、实时荧光定量PCR仪、梯度PCR、STATSPIN原位杂交仪、凝胶成像系统、电子显微镜及尸体解剖台等先进设备。
