药学部本着“以病人为中心、以质量为核心”的服务宗旨，密切结合医疗、教学和科研的需要，承担全院的药品采购、调剂、药物不良反应监测、临床药学、药物咨询、药事管理和药物治疗学委员会和药物临床试验机构等的日常工作，遵循《药品管理法》及相应规定，建立健全药品质量保障体系，保证用药安全有效和优良的服务质量。药学部现有高级职称7名，中级职称人员22名，其中硕士研究生导师1名。
近年来，药学部在学科队伍建设，药学信息化和药品管理等方面做了大量的工作。成功开发抗生素PK/PD应用软件(抗菌药物理想曲线版软件)和集诊断、实验室检查、功能检查以及药物禁忌症与一起的智能化用药监控警示互动系统，目前已在全院病区推广使用，对医生的不合理用药进行实时干预，医生的合理用药水平得到明显的提高，减少了医疗风险和患者的用药负担，缩短了平均住院日。药学信息系统内嵌入了“合理用药监测系统”（简称PASS系统）、增加了皮试系统、不合格处方记录和电子药签打印等功能。与医药公司合作，建立了供应链示范化药房，拥有自动化的发药机和分包机。
近5年来共发表论文50多篇，参加编写专著2部，获上海市卫生局、浦东新区卫生局、上海市药学会和同济大学等基金10项，为提高药学学术水平奠定了扎实的基础。
