南充市中心医院心胸外科在二十世纪五六十年代已成为外科的独立专业，80年代末已晏明全主任医师为学科带头人成为一个独立的科室。2003年10月，心胸外科与亚洲规模最大、国内第一、世界一流的心血管疾病专科医院——北京阜外心血管病医院联合成立了心血管疾病治疗协作中心，成为我国西南、西北地区与北京阜外医院建立心血管外科治疗中心的唯一医疗机构。阜外心血管病医院的知名教授长期有5人在该中心工作。此外，国内外著名的心血管外科专家胡盛寿、孙立忠、董超等教授定期来中心指导工作。该中心科里现设有床位40张，配有设备完善的重症监护室（ICU），拥有世界一流的JOSTRA体外循环机、BEAR呼吸机、连续心输出量监护仪和全套德国冠状动脉搭桥手术器械。科室现有主任医师（教授）一名，副主任医师（副教授）3名，技术骨干5名，每年施行手术700台以上。