药学部是医院的主要业务科室之一，承担着全院药品供应、药品质量安全管理、合理用药、教学及科研等任务，下设临床药学室、中西药库房、门诊中西药房、门诊中草药房、住院药房、静脉用药集中调配中心（PIVAS）等部门。现有教授1人，主任药师2人，副主任药师5人，主管药师23人。

药学部负责人吴东方教授多年来一直从事临床药学的教学、研究和管理，同时对动脉粥样硬化形成的分子机制及药物干预进行深入的探讨。近年承担有国家自然科学基金、省自然科学基金、省卫生计生委等科研项目多项，以第一作者或通讯作者在SCI源期刊及国内学术期刊发表论文50余篇。现担任湖北省药学会、湖北省药理学会、武汉市药学会理事，湖北省医学会临床药学分会、湖北省中西医结合学会药学专业委员会、武汉市药学会药物流行病学专业委员会副主任委员,《中国医院药学杂志》副主编、《医药导报》常务编委、《中国药房》及《世界临床药物》编委等。

药学部牢固树立以人为本的服务理念，建立以患者为中心的服务模式；确保药品质量安全，提供符合治疗需要的药品和全面的信息；开展药物应用研究及药物治疗学的临床研究；承担教学任务，开展继续教育和学术交流；建立药学服务的质量保障体系；逐步建立和完善临床药师制度。