1958年，华中科技大学同济医学院附属同济医院中医/中西医结合科成立，是同济医院由上海迁入武汉后最早成立的医疗业务科室之一。在几十年的发展中，先后被评为全国综合医院中医药工作示范单位、国家临床重点专科（中医妇科）、国家中医药管理局重点专科（中医内分泌），并属国家中医内分泌、中医风湿病和中医妇科新药临床试验机构。而中西医结合学科也被评为国家重点（培育）学科和湖北省一级学科重点学科、一级学科博士点、博士后流动站；中西医结合基础被评为国家首批博士、硕士授权学科点。现已建成具有一定规模的集医疗、教学、科研于一体，综合实力在国内处于领先地位的中医/中西医结合学科。

本科室现为国内综合医院规模最大的中医中西医结合科之一。病房实际开放床位155张，近10年病床使用率均超过110%。主院区中医科门诊位于门诊大楼4楼，病房位于3号楼12楼；光谷院区中医科门诊位于B区4楼，病房位于E3区4楼；中法新城院区中医科门诊位于A区3楼东，病房位于C区12楼西。三院区均设有中药房，可根据患者的需要分别提供传统汤剂、软包装中药煎剂和配方颗粒剂。

本科室现有职工115人，其中医师系列42人（在职38人，返聘4人），护理系列人员59人。高级职称19人（其中正高级职称12人，副高级职称7人），获得国务院专家津贴教授2人，国家级名老中医学术经验传承指导老师4人，湖北省中医大师2名，湖北省中医名师2名，博士生导师5人，硕士生导师11人，全国优秀中医临床人才2人。获批建立全国名老中医黄光英教授传承工作室、湖北省中医药传承事业与发展名老中医工作室（叶望云教授、陆付耳教授）。大部分医师具有博士学位及海外留学经历，多人兼任全国、省、市中医或中西医结合学术团体的重要职务。其中共有8人任中国中西结合学会常委、主任委员、理事，2人任世界中医药联合会理事，7人任湖北省中西医结合学会副会长、副主任委员、委员等职位。

本科室也高度重视青年医师的培养，2011年以来先后有8名青年医师、2名年轻护士国内进修，5人出国进修。每年开展1-2次国家级继续教育项目，举办不同层次的学术会议，积极开展国际传统医学的学术交流，先后有多名医师应邀赴美国、德国、法国、印度、泰国、巴基斯坦等国讲学或作学术报告。

本科室已培养博士、硕士研究生百余名，每年培养的中西医结合专业博士、硕士、本科生均成为国内各大医院和科研单位的骨干力量。本专业研究生多次获得国家奖学金、华中科技大学三好学生标兵、同济医院研究生十大优秀论文等荣誉称号。越来越多的研究生通过国家留学基金委资助等途径前往美国哈佛大学、耶鲁大学、贝勒医学院等国际一流大学深造。

本科室设有中医/中西医结合妇产专科、内分泌专科、风湿专科、消化专科、肿瘤专科、心脑血管病专科、男性病与不育不孕专科和针灸专科共8个临床亚专科，以其鲜明的中西医结合特色临床诊疗手段，突出的临床疗效优势在省内乃至全国享有盛誉。

中西医结合妇产专科：该专科在临床工作中针对不孕症、生殖系统炎症、月经不调、功能性子宫出血、更年期综合征、宫外孕、先兆流产、妊娠呕吐、妊娠高血压综合征、胎儿宫内生长迟缓、乳腺病等疾病以及流产和产后的康复、中老年妇女保健等方面积累了丰富的经验。研制出专科用药如少腹逐瘀片、健胎液、柴橘散结片、洁泽洗剂等制剂。中西医结合内分泌专科在糖尿病及其并发症、甲状腺疾病、更年期综合征、高血压、高脂血症、肥胖症等疾病的治疗方面，充分发挥中医和西医两大优势，二者充分结合，取长补短，融合和吸收现代医学关于内分泌与代谢性疾病的研究进展，制定了内分泌与代谢性疾病的诊疗规范。中西医结合风湿病专科，主要针对引起该病的病邪---“风寒湿”因素以及从人体免疫失调的本质入手，标本兼顾、重视远期疗效和近期疗效相结合；该专科已建立了完善的专业梯队，确定了中西医结合治疗类风湿性关节炎、强直性脊柱炎、系统性红斑狼疮、干燥综合症、多发性肌炎、痛风等多种临床顽症的临床诊治规范。中西医结合消化专科在炎症性肠病（克罗恩病、溃疡性结肠炎）、胰腺炎、消化性溃疡、慢性胃炎（特别是慢性萎缩性胃炎伴肠上皮化生的中医药治疗）、功能性消化不良、便秘、慢性腹泻、肠梗阻等消化疾病的临床诊疗中，取得了令人满意的疗效。研制出畅销不衰的专科用药如利胆化瘀片、茵虎黄片、胃肠康、消溃灵等中成药，治疗效果明显，深受病友欢迎。中西医结合肿瘤专科充分发挥中西结合治疗恶性肿瘤的优势，以扶正祛邪为主要治疗手段，对肺癌、乳腺癌、肝癌、结直肠癌、胃癌、胰腺癌及卵巢癌等恶性肿瘤的疗效尤为突出。同时在处理癌性疼痛、放射性皮炎、放射性肠炎、手足综合症、乳腺癌术后上肢水肿等方面独具特色。中西医结合心脑血管病专科采用中医中药治疗心脑血管病历史悠久，擅长治疗血管性头痛、神经性头痛、椎基底动脉供血不足、冠心病、心律失常、高血压、中风、高脂血症等多种临床顽症，疗效指标达国内先进水平。中西医结合男性病与不育不孕专科秉承祖国传统医学辨证施治之精华，结合现代关于性与生殖医学的最新成就，结合抗精子抗体、精液检查等现代诊断技术，采用纯天然中药制剂治疗多种男性病和不育不孕症，疗效满意，相关技术指标居国内领先。能够独立开展多种妇科、内分泌代谢疾病相关指标的测定，如血糖、糖化血红蛋白、胰岛素、甲状腺激素、性激素、尿微量白蛋白、血液流变学检查等。开展了腹部彩色超声检查和阴式B超检查、微循环检查、红外乳腺检查、骨密度检测、中医体质辨识等业务；开设了针刺、艾灸、中药敷帖（冬病夏治、通便、止痛等）、中医香薰疗法（如驱蚊香囊、安香囊神、防感香囊、通鼻香囊等）、耳穴疗法、刮痧疗法、拔罐疗法、中药足浴、中药茶包、穴位注射、中药灌肠、推拿等传统中医外治疗法以及气压治疗、超短波治疗、电子艾灸仪治疗、经络磁疗、中医定向透药疗法、红外线治疗、电针针刺和关节腔注射等现代康复疗法相结合的具有中医中西医特色的治疗业务。

1986年，在原中医科实验室的基础上成立了中西医结合研究所，为卫生部部属重点高等医药院校第二个成立的中西医结合研究所。中医病理生理学实验室是国家中医药管理局最高级别三级实验室。拥有高效液相色谱仪、激光多普勒血液计、荧光显微镜、荧光定量PCR仪、全自动酶标仪、二氧化碳培养箱、超净工作台、各种电泳仪、超低温冰箱等设施。2011年以来共获各类课题57项，其中国家自然科学基金40项，国家973项目1项，国家重点研发计划1项，并有1项成果获中国中西医结合学会科学技术一等奖，1项成果获湖北省科技进步一等奖，并获2项国家发明专利。发表学术论文276篇，其中SCI论文100余篇，影响因子14分以上1篇，8分以上论文3篇，并有多篇在TOP期刊发表。

2002年，在大学的支持下，以科室为主成立了中西医结合系，设立了中西医临床医学专业，并开始招收五年制本科学生。之后，科室承担同济医学院中西医临床医学五年制本科专业所有中医药学课程，同时还承担第二临床学院临床医学五年制、八年制以及口腔医学、德语班、留学生班的《中医学》双语课程，同济医学院护理学院《中医护理学》课程，是湖北省中医/中西医结合住院医师规范化培训协同基地。科室教师均具有中西医学习背景，具备深厚中西医结合理论知识，其中3名教授在德国获得博士学位，多名教师具有美国、日本、欧洲博士后或访问学者海外学习经历。2010年，《中医学》获同济医院“最受欢迎课程”；2011年，《基础中医学》获“湖北省精品课程”；2012年，中医学教研室获同济医学院第二临床学院“教学创新团队”；2017年，陆付耳教授获“宝钢优秀教师奖”；2019年，陆付耳教授获华中科技大学“教学名师”荣誉称号。主编教材有：科学出版社21世纪课程教材《基础中医学》、高等教育出版社高等院校规划教材《中医学》、人民军医出版社国家医学电子书包《中医学》。