牡丹江红旗医院拥有两台全身螺旋CT、核磁共振、数字减影血管造影机、直线加速器、准分子激光治疗仪、眼底莹光照影机、眼底激光机、玻璃体切割机、前节激光治疗机、超声乳化白内障手术仪、电脑试光仪、非接触眼压计、X线数字胃肠机、CR、全身X-刀、钴60治疗机、体外震波碎石机、三台彩色超声、多普勒诊断仪、全自动生化分析仪、血液透析机、小儿高压氧舱、智能心电综合分析仪、肛肠外科手术治疗检查系统、前列腺汽化电切镜、膀胱镜、腹腔镜、宫腔镜、阴道镜、电子胃镜、肠镜、支气管镜、骨密度仪等医疗设备。