2005年成立肾脏风湿科，2016年6月风湿科独立建科。学科带头人徐虹教授，现任风湿科主任孙利。专科医生10名，博士学位4名，硕士学位6名；高级职称4名，中级职称3名；博士生导师1名。

风湿科专科核定床位16张，周一至周日全天开设专科门诊（除国定假日外），并设有“SLE专病”和“JIA专病”门诊。年专科出院人数约1400人次，年专科门诊量约9600人次。诊治特色病种为系统性红斑狼疮（SLE）、幼年特发性关节炎（JIA）、系统性血管炎（特别是IgA血管炎——过敏性紫癜，ANCA相关性血管炎，多发性大动脉炎，结节性动脉炎）、皮肌炎、巨噬细胞活化综合征等常见儿童风湿性疾病。儿童狼疮性肾炎的中长期预后达国际先进水平。对于少见、罕见儿童风湿性疾病具备相当的诊治经验，如坏死性淋巴结炎、原发干燥综合征、硬斑病、炎症性肠病相关关节炎、结缔组织疾病相关葡萄膜炎、白塞氏病、重叠综合征、脂膜炎、结节病、系统性硬化等。近年来在单基因自身炎症性疾病和自身免疫性疾病的诊断和治疗有突破性的进展。“危重、疑难SLE的多学科团队协作（MDT）项目”为院级资助提升项目，辐射华东六省一市。是国内较早开展生物制剂使用的儿童风湿中心之一，积累了丰富的经验。是全国认证的儿科肾脏风湿GCP专业之一。

临床工作之余，多次举办“红斑狼疮俱乐部”、“幼年关节炎俱乐部”等活动，2016年成立国内首个“复旦亚太慈善专项基金”，为全国的难治性JIA患儿提供救治和帮助。长期关注儿童风湿疾病的慢病管理，与上海仁济医院、中山医院和华山医院成人风湿科，国内各儿童风湿专科，及美国辛辛那提儿童医学中心风湿科等国外儿童风湿专科有着密切交流和友好合作，使儿童风湿性疾病患儿获得更优质的全面管理和服务。