北京市海淀医院风湿免疫科成立于2005年，目前共有医生6名，其中高级职称2名，博士1人，硕士2名，护士共13名。科室特聘北医三院风湿免疫科主任刘湘源教授为学科带头人，现任科主任张舸副主任医师。门诊在东楼三层，病房在西楼六层。风湿免疫科诊治病种包括干燥综合征、类风湿关节炎、系统性红斑狼疮、强直性脊柱炎、痛风、骨关节炎、骨质疏松、血管炎、白塞病、大动脉炎、多发性肌炎等，诊治水平在全国处于先进行列。科室与检验科合作，目前能够进行的相关检查包括抗核抗体谱，抗中性粒细胞胞浆抗体，抗心磷脂抗体，抗环瓜氨酸多肽抗体、抗线粒体抗体等。开展的特色诊疗项目包括唇腺活检，B超引导下关节腔穿刺治疗，中西医结合治疗干燥综合征，小剂量环磷酰胺冲击联合中药治疗系统性红斑狼疮、多发性肌炎，中西医结合治疗ANCA相关血管炎、白塞病、大动脉炎，痛风的个体化治疗等。科室主持在研国家自然科学基金一项，横向课题三项。在国内外率先开展了干燥综合征与HPV感染的相关研究，相关研究已在国外SCI收录杂志发表3篇论文（均为第一作者），处于国际领先水平。在类风湿关节炎表观遗传学、自身免疫病与肿瘤研究方面处于国内领先水平。