海淀医院眼科是集医、教、研于一体的现代化科室，是海淀区白内障复明工程定点医院，海淀区视力残疾鉴定唯一定点医疗机构，海淀区疾控中心青少年近视防控专家组成员单位。自建院以来除对眼科各种常见病、多发病的开展诊疗及防盲知识普及推广工作外，陆续开展了白内障超声乳化联合人工晶体植入术，玻璃体切割术，视网膜脱离复位，眼内抗VEGF药物注射，多技术联合应用抗青光眼治疗手术，眼表及眼部整形修复手术，泪道疾病治疗等标志本学科国内外先进水平的眼科手术及治疗技术。自2013年与北医三院深度融合以来，科室聘请以王薇教授作为学科带头人的北大眼科中心团队定期会诊，查房，指导教学及科研工作，实现跨越式发展。目前包括北医三院出诊专家在列，有4位正主任医师，3位副主任医师，6位主治医师，2位验光师，设置眼底内科，眼底外科，青光眼白内障，眼表与泪道疾病，斜视弱视矫正及眼部整形，眼视光等6个亚专业组。
医疗特色：复杂青光眼白内障的综合诊治，慢性眼底病的系统化诊疗管理模式，青少年近视防控。
科室配备有德国徕卡显微镜，美国爱尔康超声乳化仪，荷兰道格6000切速玻璃体切割机，德国蔡司YAG激光，美国IRIDEX532，810激光，瑞士900octopus全视野计，德国海德堡光学相干断层扫描仪(OCT)，日本拓普康眼底荧光血管造影机（FFA）及脉络膜造影机（ICG），日本尼德克角膜内皮显微镜，光学生物测量仪(IOLmaster)，眼底彩色照相机，综合验光仪，焦度计，瞳距仪，日本TOMY角膜地形图，英国CLARK2002同视机，天津迈达眼科A/B超及超生生物显微镜（UBM），重庆国特眼电生理分析仪等现代化的诊查治疗设备。
