北京大学口腔医学院口腔预防科创建于1980年，是我国最早成立的口腔预防科。经历30余年的发展过程中，在杨是、卞金有、王鸿颖、张博学、王伟健教授等为代表的一批国内著名、国际知名的学科带头人引领下，现在发展成集医、教、研、防四位一体的临床科室，在口腔预防领域一直处于领先地位。

口腔预防科的医疗特色包括医院门诊和社区地段两部分。医院临床工作主要包括儿童口腔疾病和成人的龋病、牙髓病、根尖周病和牙周病的诊疗；高危人群的龋病管理；口腔疾病的预防和口腔健康教育与口腔卫生指导。社区地段临床工作主要包括学龄前儿童的口腔预防保健工作，如定期口腔健康教育和促进、定期口腔检查、窝沟封闭、局部专业用氟、早期诊断和早期治疗幼儿和学龄前儿童口腔常见疾病等，以及建立社区口腔健康档案和口腔健康教育与口腔健康促进工作。

作为国内一流的教学基地，科室承担北京大学口腔医学专业本科生、研究生的专业理论课和临床实习的教学任务，同时还承担国家级继续教育项目。在学科带头人徐韬教授和郑树国教授的领导下，北京大学口腔医学院口腔预防科已成为全国第一个口腔预防医学博士学位授予单位。在1997年和2006年分别与北京郊区密云县牙防所和西城区新街口社区卫生中心建立了农村和城市教学基地。

预防科还承担了较多的社会方面的工作，包括参与国家口腔卫生标准、工作规划和规范的制定，国家口腔卫生政策的咨询，国家口腔疾病防治项目的管理，全国爱牙日活动的组织和参与，第一、二、三次全国口腔健康流行病学的组织、实施和调查报告的起草工作，参与中华口腔医学会的工作等。口腔预防科还是世界卫生组织亚太地区唯一的科研与培训中心（WHOCC）的办公室所在地，徐韬院长还兼任这一中心的主任，该中心密切联系公共卫生，为我国培养了大量口腔公共卫生的骨干人才。此外，口腔预防科还是中国牙病防治基金会的办公室所在地，主持基金会的日常工作。