复旦大学附属眼耳鼻喉科医院检验科始建于1952年，是一个检测设备先进齐全，集医疗、教学和科研为一体的医技部门。科室位于复旦大学附属眼耳鼻喉科医院汾阳院区和浦江院区，汾阳路院区位于徐汇区汾阳路83号九号楼五层（生免微实验室和血库）和门诊一层（抽血室和临检细胞学），浦江院区位于门诊楼二层（含全部组室）。检验科按BSL-2级临床实验室要求设计，拥有生化、免疫和临检等专业的国际主流检验设备，主要包括全自动生化分析仪、全自动血细胞分析仪、尿沉渣分析仪、全自动血凝检测系统、全自动酶标系统、全自动化学发光检测系统和荧光定量核酸扩增仪等大型检验和科研设备。

检验科设科主任1名，主任助理2名，临床检验学专业医学博士和硕士占科室人员30%。科室设置临检学、临床微生物学、临床化学、临床免疫学和临床输血学五个专业学科组并常规开展临床检验。检验科的日常管理完全按照国家“医疗机构临床实验室管理办法”开展，符合并参照医院及医学实验室的ISO科学与标准化质量管理体系，坚持“以病人利益为核心、医疗安全第一”的宗旨，以“精诚、团结，求实、创新”的院训为指导，为全院每年近200万人次的患者作好检验服务。日常管理中，科室以“准确及时，持续优化”为理念，在保证检测质量的同时，不断优化检测流程，提升检测速度，门诊生化报告由原来的10小时缩短为2～3小时；门诊免疫常规报告由原来的24小时缩短为3～4小时。

目前检验科开展超过300项临床检验和科研检测项目（包括泪液、房水、玻璃体液及耳鼻喉部位的分泌物等专科特色检测项目），按时参与室间质量评价并日常开展室内质量控制活动。检验科下设的各检验专业组均参加由上海市临床检验中心组织开展的室内质量控制IQC和实验室室间质评EQA工作，全部获得通过，并获颁实验室管理质量证书。上海市临床检验中心是目前国内唯一获得WHO合作中心资质的医学实验室质量管理机构。

教学和科研方面，检验科努力探索检验与临床的结合，着力开展人类特殊感受器疾病的检验诊断和研究，形成学科梯队和专科特色、处于国内领先。检验科作为复旦大学实验诊断学硕士点和上海交通大学医学检验系实习单位，承担着复旦临床检验专业硕士生、M.B.B.S专业留学生和两校医学本科生的教学任务。