复旦大学附属眼耳鼻喉科医院麻醉科于1989年成为独立的临床科室，现有医护人员56名，其中主任医师1名，副主任医师6名，主治医师26名，住院医师7名，麻醉护士15名；80%以上的医师具有硕士或博士学位。每年完成5000余例的眼科全身麻醉和15000余例的耳鼻咽喉-头颈外科全身麻醉；喉罩麻醉、吸入麻醉和困难气道处理是科室的临床特色。现任科主任为李文献主任医师。

麻醉科目前有博士生导师1名、硕士生导师1名，作为复旦大学麻醉学博士点和硕士点以及“上海市住院医师规范化培训教学基地”，承担了研究生、住院医生和进修医生的教学和培训工作；每年为全国各地的麻醉医生举办数次临床培训。

科室开展的科研项目涉及麻醉药物对小儿和新生动物的神经发育影响、气道手术的呼吸管理、神经肌肉阻滞对面神经监测的影响等领域。迄今共获得国家自然科学基金面上项目3项、国家自然科学青年基金项目1项、市科委课题5项、上海市卫生和计划生育委员会科研课题4项，发表SCI论文27篇、核心期刊论文39篇，获得国家实用新型专利7项。

秉承医院“精诚、团结、求实、创新”的院训，麻醉科的学科定位是：服务医院发展需求、眼科和耳鼻喉科麻醉水平国内领先、医教研整体协调发展的临床学科。