中西医结合临床重点学科由山西省中西医结合医院联合中医学院中西医结合临床医学系于2006年成立二级学科，于2010年确定为国家中医药管理局重点学科建设单位。学科拥有主任医师及教授24人，副主任医师及副教授35人，主治医师60人，具有博士学位15人，硕士学位87人，博士生导师5人，硕士生导师100余人，中华医学会、中国中西医结合学会、中华中医药学会常委2人，委员9人，中国针灸学会理事1人，中华医学会山西省分会委员4人，山西省中西医结合学会专业委员会副主任1人、委员12人。

中西医结合临床是以卫生部重点专科（脑病科）、国家中医药管理局重点专科（中医外科）及山西省卫生厅中医药重点学科（内分泌科、中医妇科）为学科建设平台的依托基地，目前学科拥有5个稳定的研究方向。近年来主持科技部国际科技合作项目2项、十一五科技支撑计划1项、国家自然基金6项，国家重大新药创制专项项目1项；主持省部课题25项，市厅级课题30余项；获山西省科技进步奖7项，其中二等奖5项，3等奖2项；主编出版著作13部，获专利授权2项，发表论文300余篇、其中3篇被SCI收录。学科拥有中西医结合临床实验室、中药药理实验室、分子生物实验室等实验研究平台，采用开放式管理模式，为科研、教学、医疗活动提供硬件支持。