新生儿外科专业收治新生儿（包括早产儿）及6个月以内幼婴各种先天畸形、感染性疾病及肿瘤。表现为呕吐的常见疾病包括先天性食道闭锁、先天性肥厚性幽门狭窄、肠旋转不良、肠闭锁；表现为腹胀的主要疾病包括肛门直肠畸形、先天性巨结肠；表现为黄疸的疾病如胆道闭锁，还有一些肉眼即可见的明显畸形如腹裂、巨型脐膨出、血管瘤、淋巴管瘤、畸胎瘤等等。随着医学水平的提高，我们不仅对一些常见的疾病如先天性肥厚性幽门狭窄、肠旋转不良、肠闭锁、肛门直肠畸形、先天性巨结肠的治愈率几乎达到100%，而且开展了大量疑难病、危重病的诊治，如巨型脐膨出、膈疝、胆道闭锁的治疗，疗效已达国内领先水平。
近年来已开展的新技术及新项目有：1.经肛门I期根治巨结肠：该术式不开腹，对患儿打击小，创伤轻，恢复快，腹部无创口，住院时间短。
2.先天性胆道闭锁扩大肝门肝肠吻合术：该术式打破了胆道闭锁患儿100％死亡率的铁门，早期手术可使部分患儿治愈，亦可使部分患儿先存活下来并留下治愈的希望。
3.腹腔镜下幽门环肌切开术：我科首创的两孔法腹腔镜幽门肌切开术处于国际领先水平，该术式对腹部干扰小，肠功能恢复快，术后半年腹部几乎无可见瘢痕。
4.先天性食管闭锁胸膜外I期吻合术:该术式对胸腔干扰小，呼吸功能恢复快，免去留置胸腔闭式引流管，成活率明显提高。
5.腹腔镜下胆道探查、造影术：表现为婴幼儿梗阻性黄疸的疾病主要包括胆道闭锁、胆管发
育不良、胆汁淤积症及一些遗传代谢性疾病，这些疾病症状相似。治疗方法却不同，临床常常因为缺少特异性的早期诊断方法而延误治疗。经腹腔镜行胆道造影与切开腹壁行胆囊造影相比较可减轻对患儿创伤，如能够明确诊断系胆汁淤积症、婴儿肝炎，可不再进行开腹胆道探查术。
