病理科是医院的“最高人民法院”，对疾病诊断具有最终的裁决权，因此，病理诊断是最终诊断。病理是临床医生进行治疗的“航标灯”。为了保证最终诊断的正确性，尽量不出现“冤假错案”，55年来，病理科经过几代人不懈努力，刻苦专研，使病理科成为了全国知名的病理科。在淋巴瘤诊断、妇科病理诊断、泌尿生殖系统病理诊断、热带病病理诊断、穿刺细胞学病理诊断达到全国一流水平，具有很高影响力，成为了优势和特色专科。在免疫组化技术、组织芯片技术方面走在全国的前列。科室是全国唯一家进行了专业分工的病理科，这有力的推动了病理诊断和研究的深入。目前病理科承担着医、教、研三方面工作。在医疗上主要完成临床病理诊断（包括外检、细胞学和尸体解剖）。病理科现有工作人员22名，主任医师（教授）2人，副主任医师4人，主治医师2人，住院医师4人，技术人员10人。科室每年完成18000多例外检，50000例细胞学，淋巴瘤会诊病例每年达到1000多例。近三年发表论文50多篇，著作3本，获得国家自然科学基金1项，首都发展基金1项，获得北京市科学技术进步三等奖2项，培养研究生6名。2007年培养进修生35名。作为北京市病理住院医师培训基地，今年有2名住院医师接受培训。

病理科在淋巴瘤诊断、妇科病理诊断、泌尿生殖系统病理诊断、热带病病理诊断、穿刺细胞学病理诊断达到全国一流水平，具有很高影响力，成为了优势和特色专科。在免疫组化技术、组织芯片技术方面走在全国的前列。