小儿外科、疝外科前身普外科一区最早成立于2009年。随着医院的发展，近年来小儿外科也有了突飞猛进的发展。目前，开放正床位54张。现有医生10人，护理人员17人，其中医生高级职称3人，中级职称5人，初级职称2人，硕士2人。近年来，科室在小儿外科在临床和学科建设上形成了以腔镜微创手术为特色的专科发展道路，在新生儿食道闭锁、胆道闭锁、胆总管囊肿、先天性巨结肠、肛门闭锁等危急重症和高难度手术方面已完全普遍采用腹腔镜及微创手术治疗。国内著名小儿外科专家、北京儿童医院黄金狮教授聘为该院小儿外科客座教授，定期到该院进行会诊，手术，授课及指导小儿外科中心的建设及发展。
专科特色：1.小儿普通外科——诊治各种先天性消化道畸形、小儿肿瘤、小儿感染、小儿急腹症、腹腔镜技术等。在北部湾地区率先开展各种小儿腹腔镜手术（包括巨结肠、胆道闭锁、胆总管囊肿根治、食管裂孔疝修补、幽门狭窄、肠旋转不良、肿瘤等）。
2.新生儿外科——在新生儿胸腹部先天性结构性畸形的微创治疗方面处于北部湾沿海地区先进水平。特别在新生儿食道闭锁、胆道闭锁、肛门闭锁、十二指肠闭锁、肠旋转不良、先天性巨结肠等为代表的腔镜手术治疗和研究尤为突出。
3.小儿泌尿外科——开展腹腔镜微创手术，如小儿疝气、鞘膜积液、隐睾等。开放手术开展精准定位下迷你切口疝手术，手术切口最小仅有6毫米。此外，先天性尿道下裂等手术整形延长，效果明显。小儿包茎、包皮过长的包皮环切术以及术后的处理，有着丰富的治疗经验。
4.小儿肠套叠——在广西率先开展丙泊酚静脉麻醉下水压灌肠复位术，患儿无辐射，无痛，在北部湾地区较具影响力。
5.小儿血管瘤专科——采用多种手段的规范化治疗，在北部湾地区具有较高知名度。
诊治范围：1.小儿腹股沟疾病（疝、鞘膜积液、隐睾等）、各种血管瘤、颈部先天畸形（甲舌囊肿、鳃裂囊肿、淋巴管瘤等）。
2.小儿急腹症：阑尾炎、肠套叠、肠梗阻、重症膈疝、脐膨出等。
3.先天性消化道发育畸形（各部位肠闭锁、狭窄、肠旋转不良）、胆道异常（胆道闭锁、胆总管囊肿、胆汁淤积等）。
4.各种胸腹部实体肿瘤：纵隔肿瘤、肝母细胞瘤、肾母细胞瘤、畸胎瘤、神经母细胞瘤等。
5.新生儿外科疾病：食管闭锁、重症膈疝、脐膨出、肠闭锁、胆道闭锁、肛门闭锁、先天性巨结肠、胆总管囊肿、坏死性小肠结肠炎等。
