蒙医血液肿瘤科始建于上个世纪80年代初。1998年增加了肿瘤治疗项目，称蒙医血液肿瘤科。科室现有床位88张，40余名医护人员，其中主任医师3人、副主任医师1人、主治医师和住院医师11人，其中硕士生8人、在读博士生1人、在读硕士生1人。于2002年被评为自治区卫生厅重点科室。杭盖巴特尔主任被评为中青年学科带头人。2009年再次被评为自治区重点科室。2011年被评为国家中医药管理局蒙医血液病重点学科。科室在全体医护人员的共同努力下，积极开拓蒙医治疗血液病，肿瘤病的新领域。每年治疗的过敏性紫癜患者超过一万五千多例。在整个华北地区有了一定的知名度。受到社会和广大患者的欢迎。主要治疗过敏性紫癜、血小板减少性紫癜、再生障碍性贫血、骨髓异常增生综合症、慢性粒细胞性白血病、多发性骨髓瘤、真红细胞增多症、阵发性睡眠性血红蛋白尿等各类血液系统疾病。

科室从1998年开始应用由杭盖巴特尔主任研制的新红花八味丸、化瘤丸、解毒丸、博日七味丸、特格希II号等专科制剂于临床工作，收到较好的临床疗效。其中新红花八味丸已申请了专利。这些药的临床疗效受到广大患者的肯定。在蒙医治疗血液病、肿瘤病方面开辟了一条新途径。