全国心理咨询科三级医院排行榜排名靠前的医院有北京大学第六医院、上海市精神卫生中心、中南大学湘雅二医院、华西医院、北京安定医院,榜单医院是博禾医院库基于复旦医院排行榜、省市卫健委、卫生部以及医院等级评级和当地影响力综合产生。其中北京大学第六医院是全国精神医学科医院排行榜第1位、上海市精神卫生中心是全国精神医学科医院排行榜第2位、中南大学湘雅二医院是全国精神医学科医院排行榜第3位、华西医院是全国精神医学科医院排行榜第4位、北京安定医院是全国精神医学科医院排行榜第5位。
全国精神医学科医院排行榜第1名:北京大学第六医院是北京大学精神病学与精神卫生学的临床医疗、人才培训与科学研究基地，是世界卫生组织(WHO)北京精神卫生研究和培训协作中心，也是中国疾病预防控制中心的精神卫生中心。
全国精神医学科医院排行榜第2名:上海市精神卫生中心始建于1935年，前身为上海普慈疗养院，院址位于上海市西南郊区（现闵行区），由慈善家陆伯鸿集资建设，属教会管理，是当时远东最大、设备最完善的精神科专科医院之一。
全国精神医学科医院排行榜第3名:中南大学湘雅二医院（原湖南医科大学附属第二医院）位于历史名城，湖南省会长沙，脱胎于1906年美国雅礼协会在中国创办最早的西医院之一——雅礼医院，始建于1958年，是一所卫生部直属的大型三级甲等医院。
全国精神医学科医院排行榜第4名:四川大学华西医院起源于美国、加拿大、英国等国基督教会1892年在成都创建的仁济、存仁医院；华西临床医学院起源于1914年的华西协合大学医科，是由美、加、英等国教会按西方医学教育模式建立的医学院。
全国精神医学科医院排行榜第5名:首都医科大学附属北京安定医院创建于1914年，2000年成为首都医科大学精神卫生学院，也是全国第一所精神卫生学院，是精神病和精神卫生专业的硕士点、博士点以及应用心理学硕士点。
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