全国治疗病毒性脑炎比较好的医院包括北京协和医院、首都医科大学附属北京天坛医院、复旦大学附属华山医院、首都医科大学宣武医院、华西医院.榜单医院是博禾医院库基于复旦医院排行榜、省市卫健委、卫生部以及医院等级评级和当地影响力综合产生。北京协和医院是全国神经内科医院排行榜第1位、首都医科大学附属北京天坛医院是全国神经内科医院排行榜第2位、复旦大学附属华山医院是全国神经内科医院排行榜第3位、首都医科大学宣武医院是全国神经内科医院排行榜第4位、华西医院是全国神经内科医院排行榜第5位。
全国神经内科医院排行榜第1名:北京协和医院是集医疗、教学、科研于一体的现代化综合三级甲等医院，是国家卫生健康委指定的全国疑难重症诊治指导中心，最早承担干部保健和外宾医疗任务的医院之一，在国家三级公立医院绩效考核中两次排名第一。
全国神经内科医院排行榜第2名:首都医科大学附属北京天坛医院以神经科学集群为特色，集医、教、研、防为一体的三级甲等综合医院，是亚洲神经外科临床、科研、教学基地。国家神经系统疾病临床医学研究中心、国家神经系统疾病医疗质量控制中心。
全国神经内科医院排行榜第3名:复旦大学附属华山医院创建于1907年，是国家卫生计生委委属医院、复旦大学附属教学医院和中国红十字会冠名的医院，1992年首批通过国家三级甲等医院评审，是国内最著名、最具国际化特征的医教研中心之一。
全国神经内科医院排行榜第4名:首都医科大学宣武医院创建于1958年，是一所以神经科学和老年医学的临床与研究为重点，以治疗心脑血管疾患为特色，承担医疗、教育、科研、预防、保健和康复任务的大型三级甲等综合医院。
全国神经内科医院排行榜第5名:四川大学华西医院起源于美国、加拿大、英国等国基督教会1892年在成都创建的仁济、存仁医院；华西临床医学院起源于1914年的华西协合大学医科，是由美、加、英等国教会按西方医学教育模式建立的医学院。
