全国治疗自闭症比较好的专科医院包括北京大学第六医院、上海市精神卫生中心、中南大学湘雅二医院、四川大学华西医院、北京安定医院.榜单医院是博禾医院库基于复旦医院排行榜、省市卫健委、卫生部以及医院等级评级和当地影响力综合产生。北京大学第六医院是全国精神医学科医院排行榜第1位、上海市精神卫生中心是全国精神医学科医院排行榜第2位、中南大学湘雅二医院是全国精神医学科医院排行榜第3位、四川大学华西医院是全国精神医学科医院排行榜第4位、北京安定医院是全国精神医学科医院排行榜第5位。
全国精神医学科医院排行榜第1名:北京大学第六医院始终秉承“以科学精神体现人文关怀”的理念，以循证医学为基础，以求实创新为动力，为患者提供最优质的临床服务。经过几代人的不懈努力，形成了综合实力卓越、亚专科齐备、诊疗病种鲜明的医院特色。设有综合病房两个，收治来自全国各地的急症、重症、难治的精神障碍患者；设有特需医疗病房一个，面向高端人群和国外使领馆的外交人士；设有老年病房、儿童病房、临床心理病房、睡眠医学科病房、神经内科病房等亚专科病房以及酒药依赖和进食障碍等特色病种病房，为相关人群提供专业的精神卫生服务。
全国精神医学科医院排行榜第2名:上海市精神卫生中心始建于1935年，前身为上海普慈疗养院，院址位于上海市西南郊区（现闵行区），由慈善家陆伯鸿集资建设，属教会管理，是当时远东最大、设备最完善的精神科专科医院之一。
全国精神医学科医院排行榜第3名:中南大学湘雅二医院（原湖南医科大学附属第二医院）位于历史名城，湖南省会长沙，脱胎于1906年美国雅礼协会在中国创办最早的西医院之一——雅礼医院，始建于1958年，是一所卫生部直属的大型三级甲等医院。
全国精神医学科医院排行榜第4名:四川大学华西医院起源于美国、加拿大、英国等国基督教会1892年在成都创建的仁济、存仁医院；华西临床医学院起源于1914年的华西协合大学医科，是由美、加、英等国教会按西方医学教育模式建立的医学院。
全国精神医学科医院排行榜第5名:首都医科大学附属北京安定医院创建于1914年，2000年成为首都医科大学精神卫生学院，也是全国第一所精神卫生学院，是精神病和精神卫生专业的硕士点、博士点以及应用心理学硕士点。
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