全国治疗生殖器疱疹比较好的三甲医院包括复旦大学附属华山医院、浙江大学医学院附属第一医院、北京协和医院、南方医科大学南方医院、瑞金医院.榜单医院是博禾医院库基于复旦医院排行榜、省市卫健委、卫生部以及医院等级评级和当地影响力综合产生。复旦大学附属华山医院是全国传染感染医院排行榜第1位、浙江大学医学院附属第一医院是全国传染感染医院排行榜第2位、北京协和医院是全国传染感染医院排行榜第3位、南方医科大学南方医院是全国传染感染医院排行榜第4位、瑞金医院是全国传染感染医院排行榜第5位。
全国传染感染医院排行榜第1名:复旦大学附属华山医院创建于1907年，是国家卫生计生委委属医院、复旦大学附属教学医院和中国红十字会冠名的医院，1992年首批通过国家三级甲等医院评审，是国内最著名、最具国际化特征的医教研中心之一。
全国传染感染医院排行榜第2名:浙江大学医学院附属第一医院建院于1947年，是浙江大学创建的首家附属医院，秉持“严谨求实 卓越创新 国际一流”的发展理念，以综合实力雄厚、医疗质量过硬、学科特色鲜明享誉海内外。
全国传染感染医院排行榜第3名:北京协和医院是集医疗、教学、科研于一体的现代化综合三级甲等医院，是国家卫生健康委指定的全国疑难重症诊治指导中心，最早承担干部保健和外宾医疗任务的医院之一，在国家三级公立医院绩效考核中两次排名第一。
全国传染感染医院排行榜第4名:南方医院系南方医科大学（原第一军医大学）第一附属医院、第一临床医学院，是一所集医疗、教学、科研和预防保健为一体的大型综合性三级甲等医院，全国百佳医院。医院创建于1941年。
全国传染感染医院排行榜第5名:瑞金医院建于1907年，原名广慈医院，是一所集医疗、教学、科研为一体的三级甲等综合性医院，有着百年的深厚底蕴。医院占地面积12万平方米，建筑面积30万平方米，绿化面积4万平方米。
