全国治疗卵巢囊肿比较好的医院包括北京协和医院、复旦大学附属妇产科医院、北京大学第三医院、同济医院、浙江大学医学院附属妇产科医院.榜单医院是博禾医院库基于复旦医院排行榜、省市卫健委、卫生部以及医院等级评级和当地影响力综合产生。北京协和医院是全国妇产科医院排行榜第1位、复旦大学附属妇产科医院是全国妇产科医院排行榜第2位、北京大学第三医院是全国妇产科医院排行榜第3位、同济医院是全国妇产科医院排行榜第4位、浙江大学医学院附属妇产科医院是全国妇产科医院排行榜第5位。
全国妇产科医院排行榜第1名:北京协和医院是集医疗、教学、科研于一体的现代化综合三级甲等医院，是国家卫生健康委指定的全国疑难重症诊治指导中心，最早承担干部保健和外宾医疗任务的医院之一，在国家三级公立医院绩效考核中两次排名第一。
全国妇产科医院排行榜第2名:复旦大学附属妇产科医院设有普通妇科、妇科肿瘤科中西医结合妇科、妇科内分泌与生殖医学科宫颈与阴道早期疾病诊治中心、宫腔及输卵管疾病诊治中心、产前诊断与胎儿医学科、计划生育科、母体病理产科、普通生理科、新生儿科、乳腺科等多个全国领先优势科室。
全国妇产科医院排行榜第3名:北京大学第三医院（简称“北医三院”）建于1958年，国家卫生健康委委管医院，集医疗、教学、科研、预防保健、康复与健康管理为一体的综合性三甲医院。医院设有37个临床科室，10个医技科室。
全国妇产科医院排行榜第4名:长江之滨，黄鹤楼下，有一所海内外闻名遐迩的医院，医院先后被授予“全国五一劳动奖状”“全国职工职业道德建设十佳单位”“全国卫生系统先进集体”等光荣称号，并被评为“中国十大名牌医院”。
全国妇产科医院排行榜第5名:浙江大学医学院附属妇产科医院（浙江省妇女保健院、浙江省妇女医院）是浙江省妇产科医疗、教学、科研及计划生育、妇女保健工作的指导中心，是在华东区乃至全国有较大影响力的三级甲等妇产科专科医院。
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