全国治疗川崎病比较好的医院包括首都医科大学附属北京儿童医院、复旦大学附属儿科医院、浙江大学医学院附属儿童医院、重庆医科大学附属儿童医院、四川大学华西第二医院.榜单医院是博禾医院库基于复旦医院排行榜、省市卫健委、卫生部以及医院等级评级和当地影响力综合产生。首都医科大学附属北京儿童医院是全国医院综合实力排行榜第25位、复旦大学附属儿科医院是全国医院综合实力排行榜第30位、浙江大学医学院附属儿童医院是全国医院综合实力排行榜第70位、重庆医科大学附属儿童医院是全国医院综合实力排行榜第78位、四川大学华西第二医院是全国医院综合实力排行榜第79位。
全国医院综合实力排行榜第25名:北京儿童医院是集医疗、科研、教学、保健于一体的三级甲等综合性儿科医院，前身是我国现代儿科医学奠基人诸福棠院士于1942年创办的北平私立儿童医院。2017年批准北京儿童医院成为国家儿童医学中心(北京)。
全国医院综合实力排行榜第30名:复旦大学附属儿科医院创建于1952年，系国家卫计委预算管理单位、三级甲等医院，是集医、教、研、防为一体的综合性儿童专科医院，最早被国家授予儿科学硕士、博士学位授权点、临床医学博士后流动站。
全国医院综合实力排行榜第70名:浙江大学医学院附属儿童医院作为儿科学国家重点专科单位，医院承担着全省儿科医疗、科研、教学、儿童保健及突发性公共卫生事件应急任务。医院现设有滨江和湖滨两院区，核定床位1900张，现有职工共2400人。
全国医院综合实力排行榜第78名:重庆医科大学附属儿童医院于1956年由上海医学院儿科系迁渝创建，是集医教研为一体的国家三级甲等综合性儿童医院，最早被国家授予儿科学硕士、博士后流动站，在全国最佳医院排行榜中位居全国儿童医院第三位。
全国医院综合实力排行榜第79名:四川大学华西第二医院其华西院区730张，锦江院区850张，有22个临床科室和6个医技科室。妇产科学和儿科学均为国家重点学科，儿科学为国家精品课程，妇科、产科、儿科新生儿专业为国家临床重点专科建设项目。
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