全国治疗卵巢囊肿比较好的医院包括北京协和医院、华西医院、301医院、复旦大学附属中山医院、瑞金医院.榜单医院是博禾医院库基于复旦医院排行榜、省市卫健委、卫生部以及医院等级评级和当地影响力综合产生。北京协和医院是全国医院综合实力排行榜第1位、华西医院是全国医院综合实力排行榜第2位、301医院是全国医院综合实力排行榜第3位、复旦大学附属中山医院是全国医院综合实力排行榜第4位、瑞金医院是全国医院综合实力排行榜第5位。
全国医院综合实力排行榜第1名:北京协和医院是集医疗、教学、科研于一体的现代化综合三级甲等医院，是国家卫生健康委指定的全国疑难重症诊治指导中心，最早承担干部保健和外宾医疗任务的医院之一，在国家三级公立医院绩效考核中两次排名第一。
全国医院综合实力排行榜第2名:四川大学华西医院起源于美国、加拿大、英国等国基督教会1892年在成都创建的仁济、存仁医院；华西临床医学院起源于1914年的华西协合大学医科，是由美、加、英等国教会按西方医学教育模式建立的医学院。
全国医院综合实力排行榜第3名:中国人民解放军总医院（301医院）创建于1953年，是集医疗、保健、教学、科研于一体的大型现代化综合性医院。医院同时又是解放军医学院，以研究生教育为主，是全军唯一一所医院办学单位。
全国医院综合实力排行榜第4名:复旦大学附属中山医院是国家卫生健康委员会委属事业单位，是复旦大学附属综合性教学医院。医院开业于1937年，是中国人创建和管理的最早的大型综合性医院之一。
全国医院综合实力排行榜第5名:瑞金医院建于1907年，原名广慈医院，是一所集医疗、教学、科研为一体的三级甲等综合性医院，有着百年的深厚底蕴。医院占地面积12万平方米，建筑面积30万平方米，绿化面积4万平方米。
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