昌吉州人民医院建于1955年。是新疆昌吉地区规模最大的一所集医疗、教学、科研、预防、保健、康复、急救为一体的三级综合医院和昌吉州医疗区域中心。医院是新疆医科大学、石河子大学医学院的教学医院;是新疆医科大学第一附属医院、自治区人民医院、兰州军区乌鲁木齐总医院、福建医科大学各附属医院的技术协作医院;是福建医科大学及各附属医院和山西省长治市人民医院、中医院援疆帮扶单位;是昌吉州120紧急救援中心和昌吉州传染病医院、昌吉州精神卫生项目所在地。
2013年，医院收治门诊病人59.86万人次，收治住院患者4.04万人次，平均住院日8.7天，床位使用率100.4％，床位周转次数41.8次，为保障和增进新疆昌吉州各族人民的健康作出了积极贡献。
 

　　医院占地面积85797平方米，现有业务用房面积66980平方米。实际开放床位1100张。内设科室63个，现有在职职工1267人，其中，高级职称177人，医学研究生69人，硕士生导师2人，医学博士1名，新疆首批天山英才3名，成立新疆昌吉州高层次人才工作室一个。
 

　　近年来，医院开展了“学习型医院”、“数字化医院”、“节约型医院”、“平安医院”和“三甲医院”的“五院同创”创建活动，取得了较好效果。医院建有8个教研室和38个教研组，承担着新疆医科大学、石河子大学医学院的实习带教和昌吉卫校临床课教学及实习带教任务。医院致力于重点学科建设，先后确立了心内科、妇科、呼吸科、内分泌科等6个重点学科，目前这些重点学科和特色专科已达到地区先进水平。开展的心脏外科手术、心脏介入治疗、肿瘤介入治疗、宫腔镜、腹腔镜、关节镜等手术，填补了昌吉地区的空白。
 

　　医院拥有3.0T核磁共振、256排螺旋CT、SPECT/CT、彩超、多人医用氧舱、全自动生化分析仪、直线加速器、大C臂等大中型高精尖医疗设备和较为齐全的常规诊疗设备。目前，设备资产总值1.87亿元，固定资产原值达到4.34亿元，资产总额5.34亿元。
 

　　医院建成以门诊、住院医生工作站、门诊分诊叫号系统、影像管理系统、合理用药咨询和抗生素使用管理系统等为主要项目的医疗业务网;建成以医院办公自动化系统、医院网站、医疗远程教育(SWW)等为主要项目基于Internet的科主任工作站宽带网系统，建成了符合国家标准、全疆卫生系统一流的信息网络管理中心机房。
 

　　医院营造浓厚的宣传氛围，开展了形式多样的宣传和教育。目前，医院精心打造的六大文化名片“院报、院刊、网站、病房健康教育系统、文化长廊、感恩及健康文化节”已经成为社会和百姓了解昌吉州人民医院的最便捷的窗口和渠道。
 

　　近三年，医院先后荣获“2012年全国群众满意的医疗卫生机构”、“2012年全国文化建设先进单位”、 “2012中国医院信息化先进单位”、“2012年中国医药卫生信息技术信息化先进单位(金鼎奖)”、自治区级“文明单位”、“全国敬老文明号”、“国家级青年文明号”、“自治区“十佳医院”、“区、州级消费维权诚信单位”、昌吉州“五个好”党委等全国、区、州诸多荣誉。